Mœnia empieza en 1985 como un simple proyecto de gusto musical entre Alfonso Pichardo, Juan Carlos Lozano, Abraham Rodríguez, Carlos Mercado y Jorge Soto, que fue conocido como 5mentarios, y posteriormente, al dejar el grupo Abraham y carlos, como YSA (Young Sinners Addressed), cantando algunas canciones en inglés.
Después se contempló que el grupo grabara un disco con Polygram, cambiando su nombre de manera definitiva a Mœnia. Este disco fue grabado en 1992 y se conoce como el Disco Perdido, ya que el estilo de Mœnia no logró convencer a la compañía y apenas logró salir a la venta, por muy poco tiempo. De este disco se desprenden algunas canciones como Color Melancolía, Devoción Oscura, Tengo de tí, Canto de Vida, Confesión y No me dejes así, que duró algunas semanas en la radio, siendo una adaptación al español del tema Do not leave me this way.
Posterior a esto, Alfonso decide irse a Estados Unidos a continuar su carrera de Derecho, por lo que Jorge y Juan Carlos deciden buscar un nuevo vocalista, sin encontrar a alguien que realmente encajara en el estilo del grupo. Por fin Juan Carlos Lozano decide ser el vocal del grupo, y poco tiempo después conocen a Alejandro "Midi" Ortega; con esta nueva alineación empiezan a trabajar primero sobre el material ya formado y posteriormente con otras canciones, escritas muchas de ellas por Alfonso Pichardo. Como resultado de este trabajo, en 1996 se desprendió su segundo material discográfico llamado Mœnia bajo la compañía MCA (posteriormente Universal Mexico), incluyendo canciones como No puedo estar sin tí, Estabas ahí, Terminales, Déjame entrar, Color melancolía (rescatada del disco perdido) y No importa que el sol se muera. Después en 1998 se grabaría un disco de Remixes llamado 067.86.M.Mixes.
Luego del éxito, el grupo sufre otro cambio, Juan Carlos Lozano decide optar por un proyecto como solista, el cuál llamó Morbo, por lo que abandona la agrupación, entrando en su lugar Alfonso Pichardo, original vocalista, quien ya había concluído sus estudios.
En 1999 Mœnia, ya con la voz de Alfonso, lanza el disco Adición, con canciones muy representativas como Quisiera Adivinar, No dices más, Regreso a casa, Manto Estelar y Sin Gravedad. Aunque la "nueva" voz de Mœnia significó un cambio muy grande, la verdad es que este cambio fue para bien, ya que la voz de Alfonso ayudó en gran medida al éxito que este disco tuvo y en el porvenir general del grupo.
En 2001, Mœnia se consagra como un grupo ya maduro, con su disco Le Modulor, nombre extraído de la terminología de la arquitectura moderna del francés Le Corbusiere, el cual incluye temas muy representativos del grupo como Molde Perfecto, Llegaste a mi, Tranquilidad, En tí y ¿Cómo ves tú?
Una cuestión original de este disco es el diseño de su caja, en nada parecido al clásico rectángulo transparente con el cuadernito de fotos y letras, sino que es más bien un diseño triangular, diseñado por Jorge Soto.
Posteriormente, Mœnia saca lo que sería su siguiente disco llamado Televisor, en 2003, de donde se desprenden los temas ¿En qué momento?, Espirales, Tú sabes lo que quiero, Confinados, No es lo mismo, V-Day y Traición. Gracias al éxito del disco, fueron elegidos para realizar una canción para el programa de Big Brother, titulada Mis Ojos Sobre Tí.
Tiempo después, en el año 2005, el grupo graba el disco Stereo Hits, que consiste en una serie de versiones electrónicas de canciones conocidas de los 80's como Juegos de Amor, Mátenme porque me muero, Sildavia, Ni tú ni nadie, entre otras.
Para festejar sus 10 años de carrera artística (realmente son más, se refirieron a los años desde que abandonaron el "underground") en el 2005 lanzaron el álbum "Hits Live", el cual contiene la presentación completa llevada a cabo en el Auditorio Nacional en la Ciudad de México con 24 temas de su repertorio siendo estos los más representativos de su trayectoria.
El 22 de agosto de 2006, en la página oficial de la banda, en un boletín de noticia Mœnia les dejó saber a sus fans que ya habían terminado la producción de lo que sería un nuevo álbum en estudio. El álbum fue grabado en varias ciudades incluyendo México, Miami, Los Ángeles, Nueva York y llevó por nombre Solar. La banda también informó que el primer sencillo sería "Lo que tú digas". La banda viajó a Inglaterra para los toques finales junto con Steve Fitzmaurice, ingeniero que también se encargaría de la mezcla del álbum. Es la primera vez que Fitzmaurice trabaja con una banda latina. El álbum salió a la venta el 16 de noviembre del 2006. Llama la atención en este álbum, el tema "Me equivoqué" con la participación de Denisse Guerrero, vocalista del grupo (también de género Electro pop mexicano) Belanova.
También han participado en tributos a José José con el sencillo de "Volcán", a Hombres G con el sencillo "Huellas en la bajamar", a José Alfredo Jiménez con "Amanecí entre tus brazos" y a Soda Stereo con "Zoom". En el 2000 participo en el Soundtrack de la película Amores Perros con la canción "Lado Animal".
Luego de tres largos años el grupo Moenia está de regreso con un nuevo material discográfico y por primera vez de manera independiente bajo esquema de "joint-venture" con la marca de cerveza Sol, algo inédito en la industria músical de México. Esta producción, de Armando Ávila, lleva por título "En Eléctrico".
Este DVD es una recopilación de temás emblemáticos de la banda realizados en vivo a manera de sesión y destacando el uso de sintetizadores análogos clásicos como Arp, Moogs y Melotron entre otros.
La grabación de este nuevo disco y DVD, que sale a venta física y digital a finales de noviembre de 2009 significó una reunión con grandes amigos como Paco Huidobro de Fobia y María José, así como el reencuentro con Juan Carlos Lozano, ex vocalista de la agrupación, después de diez años de haberse separado para realizar otras inquietudes artísticas como la formación de Morbo y su lanzamiento como solista.